泌尿外科于1982年成立，经过几代人的共同努力，目前泌尿外科技术完善，设备齐全，在蚌埠及皖北地区享有良好的声誉。科室设置标准床位52张，有医师16位，护理13位，其中主任医师4位，副主任医师5位，主治医师4位，住院医师3位，博士1位，硕士11位。

目前科室有四个亚专业分组，分别是泌尿生殖系肿瘤组；结石组；前列腺疾病及男科组，尿控及盆底疾病学组。主要诊治：泌尿系结石，泌尿生殖系肿瘤，肾上腺肿瘤，前列腺疾病，尿控及盆底疾病等。泌尿外科拥有省内一流的医疗设备：双源体外震波碎石机，STORZ超高清腹腔镜、进口和国产钬激光系统、经尿道等离子电切系统、经尿道1470激光前列腺剜除镜、瑞士EMS超声碎石清石系统、WOLF输尿管硬镜、WORK电子输尿管硬镜，德国尿流动力学检测系统，目前是蚌埠地区唯一能够开展该类检查的单位，结石分析仪，取精仪，RIGSCAN性功能检测仪及前列腺治疗仪等。微创技术的开展是泌尿外科特色，熟练掌握泌尿外科各种微创技术，常规开展各种复杂高难度的技术：腹腔镜膀胱癌根治术、腹腔镜肾癌根治性切除术及肾部分切除术、腹腔镜前列腺根治术、腹腔镜肾上腺肿瘤切除术、腹腔镜下异位嗜铬细胞瘤切除术、肾周淋巴管离断术，泌尿系结石一体化治疗，如经皮肾镜碎石取石术，输尿管软镜及硬镜手术，以及良性前列腺增生电切及剜除术、膀胱肿瘤电切术等。

蚌埠三院泌尿外科作为蚌埠医科大学硕士研究生培训点，承担蚌埠医科大学的理论教学及临床培训工作。同时又是国家区域医疗中心泌尿男科专科联盟常务理事单位、安徽省泌尿外科分会委员单位、蚌埠市泌尿外科质控中心主任单位。